Poszukujemy ambitnego, zmotywowanego i w pełni zaangażowanego naukowca na stanowisko Researcher, który dołączy do zespołu realizującego projekty o wysokim potencjale translacyjnym, obejmujące zaawansowane techniki molekularne, pracę z materiałem klinicznym oraz integrację danych biologicznych.

Szukamy osoby, która traktuje naukę jako pasję, posiada silną motywację do rozwoju, potrafi samodzielnie proponować rozwiązania oraz ma chęć do publikowania, budowania dorobku naukowego i aktywnego kształtowania swojej kariery.

The successful applicant will work in Quantitative Virology Research Group and join a collaborative, vibrant, and growing community of researchers in an environment that values creativity and scientific communications in Łukasiewicz–PORT. The candidate will work with different cutting-edge methodology and techniques, including barcoding viruses, flow cytometry, ChIP-seq, Net-seq, ATAC-seq and the Hi-C technique. The candidate will join scientific discussions with other members in the team and be engaged in projects. Together with the team leader, the candidate will participate in the maintenance/organization of the laboratory and help for training newcomers. Overall, the candidate will have a great opportunity to participate in research on training and and gain knowledge and skills for his/her career development.

This position is funded by the Polish National Science Center - 2022/46/E/NZ6/00022, auxiliary position.

Synaptogenesis Research Group is a laboratory conducting multidisciplinary research on synapses in the brain and brain neuronal network, skeletal muscles, and neuromuscular junctions. Our laboratory is multicultural, with half of the lab members coming from abroad. We are committed to conducting innovative research at the best international level. We are currently recruiting a postdoctoral researcher for a project funded by the National Science Center (NCN) grant 2022/45/B/NZ3/03688. In this project, we will study the molecular mechanisms that regulate brain organization, synaptogenesis, and mouse behavior. The brain is the most complex organ in the human body, and we still have a limited understanding of its organization and function. Its malfunction leads to severe neurodevelopmental and psychiatric disorders. Our laboratory uses a wide range of techniques, including protein complex purification, mass spectrometry analysis, histology, cell culture, genetic manipulations, viral gene delivery, and behavioral testing on conditional knockout mice. By joining the project, you will learn a lot of techniques from various fields of biology, and the results obtained will likely be published in good international journals

Poszukujemy ambitnego, zmotywowanego i w pełni zaangażowanego naukowca na stanowisko Researcher, który dołączy do zespołu realizującego projekty o wysokim potencjale translacyjnym, obejmujące zaawansowane techniki molekularne, pracę z materiałem klinicznym oraz integrację danych biologicznych.

Szukamy osoby, która traktuje naukę jako pasję, posiada silną motywację do rozwoju, potrafi samodzielnie proponować rozwiązania oraz ma drive do publikowania, budowania dorobku naukowego i aktywnego kształtowania swojej kariery.

A position is available in the Research Group Quantitative Virology at Łukasiewicz-PORT. We are looking for a highly enthusiastic person to strengthen our interdisciplinary team in exciting research combining state-of-the-art genetic approaches with advanced molecular and physiological readouts. In this project, we aim to investigate the molecular basis of HIV-1 antisense transcripts associated with its latency. We will manipulate barcoded wildtype HIV-1 and conduct experiments using several “omics” technologies, including B-HIVE, RNA-seq, ChIP-seq, ATAC-seq, MNase-seq, HIV-1-capture HiC followed by high-throughput sequencing to characterize the molecular microenvironments of the latent HIV reservoir, especially those harboring proviruses at a deeper level of latency. Lastly, we will integrate these multidimensional datasets generated in this project to establish a deep learning-based quantitative model, enabling the prediction of the likelihood of the molecular microenvironments of the latent HIV reservoir.

Expectations:

• M.Sc. degree (or final year of MSc studies) in biological sciences or related field supported with at least 1 year of hands-on laboratory experience.
• Excellent interpersonal and communication skills.
• Very good work organization and time management.
• Experienced to work in interdisciplinary teams.
• Conscientiousness and accuracy.
• Professional level of English.
• Experience in cell culture.
• Experience in molecular biology techniques (molecular cloning, PCR, RT-PCR, qPCR).
• Enthusiastic about learning (new knowledge and techniques).

• Viral manipulation, including viral transduction and transfection
• Cell culture.
• Perform molecular biology techniques, including PCR, RT-PCR, qPCR, and prepare high-throughput sequencing libraries.
• FACS sorting.
• Participate in writing the manuscript
• Data analysis, interpretation, visualization.
• Keeping an industry-standard work documentation.

Stanowisko finansowane przez Narodowe Centrum Nauki w ramach konkursu „OPUS 22”, realizowanego w ramach umowy grantowej nr UMO-2021/43/B/ST8/01924 – projekt „Badania nad mikrobiologicznym mechanizmem zwiększania produkcji biometanu z bioodpadów przez typowe materiały węglowe”.

Grupa Badawcza Immunoterapii w Sieci Badawczej Łukasiewicz – PORT Polskim Ośrodku Rozwoju Technologii poszukuje post-doca do realizacji projektu finansowanego przez Narodowe Centrum Nauki (NCN) pn.: Analiza skuteczności immunoterapii glejaka z wykorzystaniem limfocytów T gamma-delta.

Kandydat musi spełniać wymagania Regulaminu Projektów NCN, w szczególności: Na stanowisku post-doc może być zatrudniona osoba, która uzyskała stopień naukowy doktora w roku zatrudnienia w projekcie lub w okresie 7 lat przed dniem 1 stycznia roku zatrudnienia w projekcie (okres ten może ulec wydłużeniu w niektórych przypadkach) oraz spełnia wymogi formalne Narodowego Centrum Nauki określone w regulaminie przyznawania środków na realizację zadań finansowanych przez Narodowe Centrum Nauki w zakresie projektów badawczych w ramach konkursu.

• Realizacja zadań badawczych związanych z projektem.
• Opracowywanie oraz interpretacja wyników badań.
• Współpraca z zespołem badawczym przy interpretacji danych i planowaniu kolejnych eksperymentów.
• Przygotowywanie zestawień danych, raportów i materiałów do prezentacji wewnętrznych i zewnętrznych.
• Udział w opracowywaniu materiałów do publikacji naukowych i dokumentacji projektowej.
• Dbanie o wysoką jakość i rzetelność przetwarzanych danych badawczych.

Stanowisko dotyczy realizacji zadań w ramach projektu Teaming for Excellence – P4Health, a także kluczowych KPI związanych z procesami biobankowania. Jest to stanowisko wspierające realizację projektu badawczego i  odegra kluczową rolę w opracowaniu narzędzi wspierających procesy badawcze i decyzyjne, umożliwiających badaczom eksplorację danych biobankowych w sposób interaktywny i intuicyjny.

• Tworzenie modeli o klasyfikacji oraz analizy danych biobankowych
• Opracowanie metod łączenia danych biologicznych, klinicznych, demograficznych i obrazowych
• Wdrażanie środowiska obliczeniowego umożliwiającego przetwarzanie dużych ilości danych
• Tworzenie i rozwój narzędzi wspierających analizę danych
• Walidacja i testowanie opracowanych modeli
• Współpraca z Zespołem badawczym, klinicystów

Osoba zatrudniona na tym stanowisku będzie odgrywać kluczową rolę w realizacji projektu w ramach konsorcjum RCMC, odpowiadając za zarządzanie cyklem życia danych – w szczególności danych obrazowych – oraz za wdrożenie i administrację systemem biobankowania. Do zakresu obowiązków będzie należeć również generowanie i analiza obrazów histopatologicznych.

Stanowisko to jest niezbędne z uwagi na konieczność zapewnienia pełnej zgodności, spójności oraz funkcjonalności systemu biobanku, obejmującego zarówno dane dotyczące próbek biologicznych, jak i powiązane z nimi dane obrazowe.

• Czyszczenie danych, zapewnianie dokładności, spójności i kompletności.
• Przygotowanie baz danych do dalszych analiz.
• Digitalizacja preparatów histopatologicznych i analiza obrazów histopatologicznych.
• Wsparcie techniczne w projektach badawczym (RCMC ABMPath).
• Tworzenie skryptów i narzędzi wspomagających przetwarzanie danych biomedycznych.
• Współpraca z zespołami interdyscyplinarnymi (bioinformatycy, naukowcy).

In this project, we aim to investigate the molecular basis of HIV-1 antisense transcripts associated with its latency. We will manipulate barcoded wildtype HIV-1 and conduct experiments using several “omics” technologies, including B-HIVE, RNA-seq, ChIP-seq, ATAC-seq, MNase-seq, HIV-1-capture HiC followed by high-throughput sequencing to characterize the molecular microenvironments of the latent HIV reservoir, especially those harboring proviruses at a deeper level of latency. Lastly, we will integrate these multidimensional datasets generated in this project to establish a deep learning-based quantitative model, enabling the prediction of the likelihood of the molecular microenvironments of the latent HIV reservoir.  The candidate will be involved in above in daily task.

• Viral manipulation, including viral transduction and transfection
• Cell culture
• Perform molecular biology techniques, including PCR, RT-PCR, qPCR, and prepare high-throughput sequencing libraries
• FACS sorting
• Participate in writing the manuscript
• Participate lab activities (e.g., lab meeting and journal club and so on)
• Data analysis, interpretation, visualization
• Keeping an industry-standard work documentation.

Celem stanowiska jest zapewnienie zgodności finansowej i administracyjnej realizowanych projektów z obowiązującymi przepisami, wytycznymi instytucji finansujących oraz wewnętrznymi procedurami instytutu.

Osoba zatrudniona na tym stanowisku będzie podlegać Kierownikowi Działu Rozliczania Projektów i współpracować z zespołami projektowymi, departamentem finansów i księgowości, departamentem HR oraz biurem prawnym. Będzie pełnić kluczową rolę w zapewnieniu prawidłowego rozliczania projektów, wspierając zespoły badawcze w zakresie finansowym i administracyjnym. Zadaniem osoby zatrudnionej będzie wsparcie zespołu w zakresie rozliczania i monitorowania projektów finansowanych ze źródeł zewnętrznych, takich jak fundusze unijne czy krajowe programy badawcze.  Szukamy osoby skrupulatnej, dobrze zorganizowanej, z doświadczeniem w pracy z projektami dotowanymi, która potrafi łączyć wiedzę finansową z umiejętnością interpretacji dokumentacji projektowej i przepisów.

• Monitorowanie i zarządzanie grupą projektów.
• Nadzór wszystkimi etapami realizacji projektów, włącznie z planowaniem, wdrażaniem i monitorowaniem postępów projektów.
• Zapewnienie zgodności projektów z obowiązującymi przepisami prawnymi oraz regulacjami dotyczącymi finansowania.
• Bieżący monitoring wykorzystania budżetu i alokacja zasobów.
• Ocena kwalifikowalności kosztów i zatwierdzanie wydatków w projektach.
• Prowadzenie dokumentacji projektowej i archiwizacja dokumentów związanych z projektami.
• Przygotowywanie raportów/sprawozdań/wniosków o płatność dot. postępów realizacji projektów i wykorzystania środków finansowych.
• Przygotowywanie wniosków o zmiany w realizowanych projektach.
• Przygotowywanie dokumentacji projektowych do kontroli wewnętrznych, zewnętrznych oraz audytów.
• Opisywanie dokumentów finansowych związanych z realizacją projektów pod kątem zgodności z harmonogramem i budżetem projektów.

Stanowisko dotyczy realizacji zadań w ramach projektu Teaming for Excellence – P4Health oraz projektu badawczego w obszarze BIA-ALCL, a także kluczowych KPI związanych z procesami biobankowania. Jest to stanowisko wspierające realizację projektu badawczego, obejmujące zarówno procesy laboratoryjne, jak i opracowywanie materiału biologicznego (krwi i innych próbek biologicznych, jak i implantacyjnego) zgodnie z obowiązującymi procedurami jakości i standardami pracy Biobanku.

• pobieranie i zabezpieczanie kolekcji materiału biologicznego (m.in. krew, inne próbki kliniczne)
• właściwe oznakowanie, ewidencjonowanie i przekazywanie próbek do Biobanku zgodnie z obowiązującymi procedurami jakości
• współpracę z klinikami onkologicznymi i chirurgii (m.in. chirurgii piersi)
• zapewnienie prawidłowego łańcucha custody materiału biologicznego (od pacjenta do biobanku)
• zbieranie i analizowanie danych pacjentów

• Nadzór nad realizacją programu WIB i dokumentacją programową
• Współpraca z Ministerstwem Nauki i Szkolnictwa Wyższego w zakresie zarządzania, wdrażania i monitorowania programu WIB
• Nadzór nad organizowaniem i przeprowadzaniem konkursów
• Zawieranie umów o realizacji i finansowania projektów
• Nadzór nad przyznawaniem środków finansowych na badania zakwalifikowane do finansowania
• Nadzór nad realizacją projektów finansowanych w ramach programu WIB
• Nadzór nad rozliczaniem środków finansowych wydatkowanych w ramach projektów badawczych
• Planowanie i sprawozdawczość w zakresie realizacji programu WIB
• Nadzór nad procesami związanymi z ochroną własności intelektualnej i procesami komercjalizacji
• Aktywny udział w poszukiwaniu odbiorców własności intelektualnej (kontakt z funduszami inwestycyjnymi, udział w konferencjach krajowych i zagranicznych)